SEKVENOVÁNÍ VZORKŮ DNA/RNA HMYZU

Předmětem veřejné zakázky je sekvenování vzorků DNA/RNA hmyzu. Jedna sada vzorků se bude skládat ze čtyř dílčích sad vzorků, které poskytneme my jako zákazníci: Vzorový podsoubor 1) Šest celkových vzorků DNA hmyzu bude předloženo jako jedna dávka k sekvenování pomocí sekvenačních platforem a buněk PacBio Hifi Revio. Tři vzorky budou …

CPV: 71900000 Usługi laboratoryjne, 73111000 Laboratoryjne usługi badawcze
Termin:
27 stycznia 2025 10:00
Rodzaj terminu:
Złożenie oferty
Miejsce wykonania:
SEKVENOVÁNÍ VZORKŮ DNA/RNA HMYZU
Miejsce udzielenia zamówienia:
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Numer nagrody:
VZ0202184

1. Kupující

1.1 Kupující

Oficiální název : Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Právní forma kupujícího : Veřejnoprávní subjekt ovládaný ústředním orgánem státní správy
Činnost veřejného zadavatele : Vzdělávání

2. Řízení

2.1 Řízení

Název : SEKVENOVÁNÍ VZORKŮ DNA/RNA HMYZU
Popis : Předmětem veřejné zakázky je sekvenování vzorků DNA/RNA hmyzu. Jedna sada vzorků se bude skládat ze čtyř dílčích sad vzorků, které poskytneme my jako zákazníci: Vzorový podsoubor 1) Šest celkových vzorků DNA hmyzu bude předloženo jako jedna dávka k sekvenování pomocí sekvenačních platforem a buněk PacBio Hifi Revio. Tři vzorky budou sekvenovány triplexně na jedné buňce, to znamená, že pro šest vzorků budou použity celkem dvě sekvenační buňky. Každý vzorek bude tvořen hmyzí DNA o vysoké molekulové hmotnosti (izolovanou pomocí soupravy MagAttract) s množstvím DNA 300-500ng ve 100-200 µl vody. Požadovaná služba spočívá v přípravě knihoven HiFi PacBio pomocí chemie SPRQ bez amplifikace celého genomu PCR, sekvenování na buňkách Revio PacBio a poskytnutí dat ze sekvenování HiFi prostřednictvím fyzicky dodaných pevných disků nebo prostřednictvím online datového úložiště. Vzorový podsoubor 2) 96 vzorků DNA celého genomu hmyzu izolovaných pomocí soupravy Qiagen Blood & Tissue (nebo srovnatelné soupravy) s celkovým množstvím DNA alespoň 20 ng na vzorek bude předloženo jako jedna dávka 96 vzorků. Požadovanou službou je příprava knihoven Illumina a sekvenování s párovým koncem 150bp s minimálním výtěžkem sekvenačních čtení na vzorek 5 gigabází a poskytnutí sekvenačních dat prostřednictvím fyzicky zaslaných pevných disků nebo prostřednictvím online úložiště dat. Vzorový podsoubor 3) 24 vzorků celkové RNA hmyzu izolovaných pomocí soupravy ZymoResearch Direct-zol (nebo srovnatelné soupravy) s celkovým množstvím RNA nejméně 50ng na vzorek bude poskytnuto jako jedna dávka. Požadovanou službou je příprava knihovny RNAseq s obohacením o polyA a následné sekvenování Illumina 150bp s párovým koncem s minimálním výtěžkem sekvenování na vzorek 10 gigabází a poskytnutí sekvenačních dat prostřednictvím fyzicky dodaných pevných disků nebo prostřednictvím online úložiště dat. Vzorový podsoubor 4) 96 knihoven Illumina připravených z celkové DNA hmyzu bude předloženo jako jedna dávka. Knihovny budou indexovány pomocí "NEBNext Oligos for Illumina 96 Unique Dual Index Primers Pair set 5" nebo srovnatelného systému Unique Dual Index. Požadovanou službou je kontrola kvality knihoven, sdružování a sekvenování Illumina 150bp s párovým koncem s minimálním výtěžkem sekvenačních čtení na vzorek 5 gigabází a poskytnutí sekvenačních dat prostřednictvím fyzicky dodaných pevných disků nebo prostřednictvím online úložiště dat.
Identifikátor řízení : 4b3ba002-3777-44a0-9122-0d8e3d1c2b8d
Interní identifikátor : VZ0202184
Typ řízení : Otevřené
Řízení se zrychlí : ne
Odůvodnění zrychleného řízení :
Hlavní prvky řízení :

2.1.1 Účel

Charakter smlouvy : Služby
Hlavní klasifikace ( cpv ): 71900000 Laboratorní služby
Další klasifikace ( cpv ): 73111000 Laboratorní výzkum

2.1.2 Místo plnění

Nižší územní jednotka země (NUTS) : Jihočeský kraj ( CZ031 )
Země : Česko
Další informace : Branišovská 1160/31, 370 05 České Budějovice

2.1.3 Hodnota

Odhadovaná hodnota bez DPH : 4 738 017 Česká koruna

2.1.4 Obecné informace

Právní základ :
Směrnice 2014/24/EU
32014L0024 - Směrnice Evropského parlamentu a Rady 2014/24/EU ze dne 26. února 2014 o zadávání veřejných zakázek a o zrušení směrnice 2004/18/ES
134/2016 Sb. - Zákon o zadávání veřejných zakázek

2.1.6 Důvody pro vyloučení

Čistě vnitrostátní důvody pro vyloučení : Důvody vyloučení účastníka zadávacího řízení jsou definovány zákonem č. 134/2016 Sb., o zadávání veřejných zakázek, v platném znění. Zadavatel požaduje předložení základní způsobilosti dle § 74 zákona č. 134/2016 Sb., o zadávání veřejných zakázek, v platném znění. Bližší informace jsou uvedeny v zadávací dokumentaci.

5. Část

5.1 Technické ID šarže : LOT-0001

Název : SEKVENOVÁNÍ VZORKŮ DNA/RNA HMYZU
Popis : Předmětem veřejné zakázky je sekvenování vzorků DNA/RNA hmyzu. Jedna sada vzorků se bude skládat ze čtyř dílčích sad vzorků, které poskytneme my jako zákazníci: Vzorový podsoubor 1) Šest celkových vzorků DNA hmyzu bude předloženo jako jedna dávka k sekvenování pomocí sekvenačních platforem a buněk PacBio Hifi Revio. Tři vzorky budou sekvenovány triplexně na jedné buňce, to znamená, že pro šest vzorků budou použity celkem dvě sekvenační buňky. Každý vzorek bude tvořen hmyzí DNA o vysoké molekulové hmotnosti (izolovanou pomocí soupravy MagAttract) s množstvím DNA 300-500ng ve 100-200 µl vody. Požadovaná služba spočívá v přípravě knihoven HiFi PacBio pomocí chemie SPRQ bez amplifikace celého genomu PCR, sekvenování na buňkách Revio PacBio a poskytnutí dat ze sekvenování HiFi prostřednictvím fyzicky dodaných pevných disků nebo prostřednictvím online datového úložiště. Vzorový podsoubor 2) 96 vzorků DNA celého genomu hmyzu izolovaných pomocí soupravy Qiagen Blood & Tissue (nebo srovnatelné soupravy) s celkovým množstvím DNA alespoň 20 ng na vzorek bude předloženo jako jedna dávka 96 vzorků. Požadovanou službou je příprava knihoven Illumina a sekvenování s párovým koncem 150bp s minimálním výtěžkem sekvenačních čtení na vzorek 5 gigabází a poskytnutí sekvenačních dat prostřednictvím fyzicky zaslaných pevných disků nebo prostřednictvím online úložiště dat. Vzorový podsoubor 3) 24 vzorků celkové RNA hmyzu izolovaných pomocí soupravy ZymoResearch Direct-zol (nebo srovnatelné soupravy) s celkovým množstvím RNA nejméně 50ng na vzorek bude poskytnuto jako jedna dávka. Požadovanou službou je příprava knihovny RNAseq s obohacením o polyA a následné sekvenování Illumina 150bp s párovým koncem s minimálním výtěžkem sekvenování na vzorek 10 gigabází a poskytnutí sekvenačních dat prostřednictvím fyzicky dodaných pevných disků nebo prostřednictvím online úložiště dat. Vzorový podsoubor 4) 96 knihoven Illumina připravených z celkové DNA hmyzu bude předloženo jako jedna dávka. Knihovny budou indexovány pomocí "NEBNext Oligos for Illumina 96 Unique Dual Index Primers Pair set 5" nebo srovnatelného systému Unique Dual Index. Požadovanou službou je kontrola kvality knihoven, sdružování a sekvenování Illumina 150bp s párovým koncem s minimálním výtěžkem sekvenačních čtení na vzorek 5 gigabází a poskytnutí sekvenačních dat prostřednictvím fyzicky dodaných pevných disků nebo prostřednictvím online úložiště dat.
Interní identifikátor : VZ0202184

5.1.1 Účel

Charakter smlouvy : Služby
Hlavní klasifikace ( cpv ): 71900000 Laboratorní služby
Další klasifikace ( cpv ): 73111000 Laboratorní výzkum
Možnosti :
Popis možností : Vyhrazené změny závazku jsou uvedeny v Návrhu smlouvy.

5.1.2 Místo plnění

Nižší územní jednotka země (NUTS) : Jihočeský kraj ( CZ031 )
Země : Česko
Další informace : Branišovská 1160/31, 370 05 České Budějovice

5.1.3 Odhadovaná doba trvání

Datum zahájení : 28/02/2025
Datum konce trvání : 31/12/2027

5.1.5 Hodnota

Odhadovaná hodnota bez DPH : 4 738 017 Česká koruna

5.1.6 Obecné informace

Vyhrazená účast : Účast není vyhrazena.
Musí být uvedena jména a příslušná odborná kvalifikace pracovníků pověřených realizací zakázky : Nevyžaduje se
Projekt veřejných zakázek plně nebo částečně financovaný z prostředků EU
Na zakázku se vztahuje Dohoda o vládních zakázkách : ano
Tato zakázka je vhodná i pro malé a střední podniky

5.1.7 Strategické zadávání zakázek

Cíl strategického zadávání zakázek : Plnění sociálních cílů
Popis : Podpora přístupu malých a středních podniků - snížení administrativní náročnosti účasti v zadávacím řízení (zadavatel umožňuje prokazování kvalifikace prostřednictvím čestného prohlášení), požadavek zadavatele na férové vztahy v dodavatelském řetězci a nastavení přiměřených smluvních podmínek.
Prosazovaný sociální cíl : Přístupnost pro všechny

5.1.9 Kritéria pro výběr

Kritérium :
Typ : Vhodnost pro výkon odborné činnosti
Popis : Dle § 77 odst. 1 zákona výpis z obchodního rejstříku nebo jiné obdobné evidence, pokud jiný právní předpis zápis do takové evidence vyžaduje.

5.1.10 Kritéria pro zadání

Kritérium :
Typ : Cena
Jméno/název : Modelová nabídková cena v Kč bez DPH
Popis : Dodavatel stanoví nabídkovou cenu jako cenu za sekvenční sadu vzorků (tj. za 4 podskupiny vzorků uvedené v čl. 3.1 zadávací dokumentace), a to v Kč. V případě hodnocení nabídek podle kritéria "Modelová nabídková cena" získá hodnocená nabídka bodovou hodnotu (maximálně 95 bodů odpovídajících váze kritéria). Hodnocená nabídka získá bodovou hodnotu, která vznikne poměrem hodnoty nejvýhodnější nabídky (dále jen "nejvýhodnější nabídka") k hodnocené nabídce (dále jen "hodnocená nabídka"). Výsledná hodnota pak bude vážena procentní vahou tohoto dílčího kritéria (95 %).
Váha (procenta, přesně) : 95
Kritérium :
Typ : Kvalita
Jméno/název : Doba plnění
Popis : Hodnocení bude probíhat podle termínu plnění, tj. poskytnutí výsledků sekvenování zadavateli, stanoveného ode dne, kdy dodavatel obdrží vzorky (dále jen "termín plnění"), v celých týdnech (viz čl. II odst. 4 rámcové dohody). Za nejvýhodnější nabídku v tomto dílčím kritériu bude považována nabídka s nejkratším termínem plnění, tj. poskytnutí výsledků sekvenace zadavateli. Maximální lhůta pro plnění, tj. poskytnutí výsledků sekvenování zadavateli, kterou může dodavatel uvést v nabídce, je 9 týdnů ode dne, kdy dodavatel obdrží vzorky. Pokud dodavatel v nabídce uvede delší lhůtu plnění, bude ze zadávacího řízení vyloučen pro nesplnění zadávacích podmínek. Nejkratší lhůta plnění, tj. poskytnutí výsledků sekvenování zadavateli pro účely hodnocení, je 5 týdnů ode dne, kdy dodavatel obdrží vzorky. V případě, že dodavatel ve své nabídce uvede kratší termín plnění, nebude doba přesahující nejkratší termín plnění (tj. 5 týdnů) při hodnocení zohledněna a dodavatel obdrží body odpovídající hodnotě 5 týdnů. Hodnocená nabídka získá bodovou hodnotu, která vznikne poměrem hodnoty nejvýhodnější nabídky ("nejvýhodnější nabídka") k hodnocené nabídce ("hodnocená nabídka"). Výsledná hodnota pak bude vážena procentní vahou tohoto dílčího kritéria (5 %).
Váha (procenta, přesně) : 5
Popis metody, která se použije v případě, že vážení nelze vyjádřit pomocí kritérií :
Odůvodnění neuvedení váhy kritérií pro zadání :

5.1.11 Zadávací dokumentace

5.1.12 Podmínky zadávání zakázek

Podmínky podání :
Elektronické podání : Požadována
Jazyky, v nichž lze podávat nabídky nebo žádosti o účast : čeština, angličtina
Elektronický katalog : Nepovolena
Varianty : Nepovolena
Lhůta pro doručení nabídek : 27/01/2025 10:00 +01:00
Smluvní podmínky :
Plnění zakázky musí být provedeno v rámci programů chráněného zaměstnání : Ne
Elektronická fakturace : Požadována
Bude použito elektronické objednávání : ano
Bude použita elektronická platba : ano
Finanční ujednání : Veřejná zakázka bude spolufinancována Grantovou agenturou České republiky. Grantový projekt v základním výzkumu Junior Star 2023 Název projektu: Trajektorie evoluce genomu u konvergentních organismů Odborový výbor: EX-5 - Biologie a zemědělské vědy Platební podmínky jsou specifikovány v návrhu smlouvy.
Informace o lhůtách pro přezkum : Podmínkou pro podání návrhu k ÚOHS je podání námitek k Zadavateli, které je nutné doručit do 15 dnů ode dne, kdy se stěžovatel dozvěděl o domnělém porušení zákona Zadavatelem, nejpozději však do uzavření smlouvy nebo do chvíle, kdy se soutěž o návrh považuje po výběru návrhu za ukončenou. Námitky proti úkonům oznamovaným v dokumentech, které je Zadavatel povinen podle zákona uveřejnit či odeslat stěžovateli, musí být doručeny Zadavateli do 15 dnů od jejich uveřejnění či doručení stěžovateli. Pokud je v zadávacím řízení stanovena lhůta pro podání žádostí o účast, musí být námitky proti podmínkám vztahujícím se ke kvalifikaci dodavatele doručeny Zadavateli nejpozději do skončení této lhůty. Pokud je v zadávacím řízení stanovena lhůta pro podání nabídek, musí být námitky proti zadávacím podmínkám doručeny Zadavateli nejpozději do skončení této lhůty. Námitky proti obsahu výzvy k podání nabídek v dynamickém nákupním systému nebo při zadávání veřejné zakázky na základě rámcové dohody musí být zadavateli doručeny nejpozději do konce lhůty pro podání nabídek. V soutěži o návrh musí být námitky proti soutěžním podmínkám doručeny nejpozději do konce lhůty pro podání návrhů. Zadavatel může v zadávací dokumentaci nebo soutěžních podmínkách stanovit, že námitky podle § 242 odst. 3 nebo 4 zákona lze podat nejpozději 72 hodin před skončením lhůt podle § 242 odst. 3 nebo 4 zákona. Námitky proti dobrovolnému oznámení o záměru uzavřít smlouvu podle § 212 odst. 2 zákona musí být doručeny Zadavateli do 30 dnů od uveřejnění tohoto oznámení. Zadavatel je povinen námitky vyřídit do 15 dnů. Návrh je nutné doručit ÚOHS i Zadavateli do 10 dnů ode dne, v němž stěžovatel obdržel rozhodnutí, kterým Zadavatel námitky odmítnul nebo do 25 dnů od odeslání námitek, pokud Zadavatel o námitkách nerozhodl. Po uzavření smlouvy na veřejnou zakázku či rámcové dohody lze podat pouze návrh na uložení zákazu plnění smlouvy, a to i bez předchozího podání námitek. Návrh na uložení zákazu plnění smlouvy doručí navrhovatel ÚOHS a ve stejnopisu Zadavateli do 30 dnů ode dne, kdy Zadavatel uveřejnil oznámení o uzavření smlouvy způsobem podle § 212 odst. 2 zákona s uvedením důvodu pro zadání veřejné zakázky bez uveřejnění oznámení o zahájení zadávacího řízení, předběžného oznámení nebo výzvy k podání nabídek ve zjednodušeném podlimitním řízení, nejpozději však do 6 měsíců od uzavření této smlouvy. Návrh na uložení zákazu plnění smlouvy podle § 254 odstavce 1 písm. d) zákona doručí navrhovatel ÚOHS a ve stejnopisu Zadavateli do 30 dnů ode dne, kdy Zadavatel uveřejnil oznámení o uzavření smlouvy na základě rámcové dohody podle § 137 zákona nebo oznámení o uzavření smlouvy v dynamickém nákupním systému podle § 142 zákona, nejpozději však do 6 měsíců od uzavření této smlouvy. Ve lhůtě pro doručení návrhu je navrhovatel povinen složit na účet ÚOHS kauci ve výši 1 % z nabídkové ceny navrhovatele za celou dobu plnění veřejné zakázky nebo za dobu prvních čtyř let plnění v případě smluv na dobu neurčitou, nejméně však ve výši 50 000 Kč, nejvýše ve výši 10 000 000 Kč. V případě, že navrhovatel nemůže stanovit celkovou nabídkovou cenu, je povinen složit kauci ve výši 100 000 Kč. V případě návrhu na uložení zákazu plnění smlouvy je navrhovatel povinen složit kauci ve výši 200 000 Kč. Jde-li o řízení o přezkoumání postupu pro zadávání koncesí, je navrhovatel povinen ve lhůtě pro doručení návrhu složit na účet ÚOHS kauci ve výši 1 % z předpokládané hodnoty koncese uveřejněné ve Věstníku veřejných zakázek nebo na profilu Zadavatele, nejméně však ve výši 50 000 Kč, nejvýše ve výši 10 000 000 Kč. V případě, že Zadavatel neuveřejní ve Věstníku veřejných zakázek nebo na profilu Zadavatele předpokládanou hodnotu koncese, je navrhovatel povinen složit kauci ve výši 100 000 Kč. V případě návrhu na uložení zákazu plnění koncesní smlouvy je navrhovatel povinen složit kauci ve výši 200 000 Kč.

5.1.15 Techniky

Rámcová dohoda :
Rámcová dohoda bez obnovení soutěže
Informace o dynamickém nákupním systému :
Žádný dynamický nákupní systém
Elektronická aukce : ne

5.1.16 Další informace, mediace a přezkum

Organizace příslušná pro přezkum : Úřad pro ochranu hospodářské soutěže
Organizace poskytující další informace o zadávacím řízení : Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Organizace poskytující přístup k zadávací dokumentaci v režimu offline : Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Organizace poskytující další informace o podání návrhů na přezkum : Úřad pro ochranu hospodářské soutěže

8. Organizace

8.1 ORG-0001

Oficiální název : Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Registrační číslo : 60077344
Poštovní adresa : Branišovská 1160/31
Obec : České Budějovice
PSČ : 37005
Nižší územní jednotka země (NUTS) : Jihočeský kraj ( CZ031 )
Země : Česko
Kontaktní místo : Biologické centrum AV ČR, v. v. i. Ing. Šárka Alešová
Telefon : +420 387775295
Internetová adresa : https://www.bc.cas.cz
Úlohy této organizace :
Kupující
Organizace poskytující další informace o zadávacím řízení
Organizace poskytující přístup k zadávací dokumentaci v režimu offline

8.1 ORG-0002

Oficiální název : Úřad pro ochranu hospodářské soutěže
Registrační číslo : 65349423
Poštovní adresa : třída Kpt. Jaroše 1926/7
Obec : Brno
PSČ : 60200
Nižší územní jednotka země (NUTS) : Jihomoravský kraj ( CZ064 )
Země : Česko
Telefon : +420 542167111
Internetová adresa : https://uohs.gov.cz
Úlohy této organizace :
Organizace příslušná pro přezkum
Organizace poskytující další informace o podání návrhů na přezkum

11. Oznámení - informace

11.1 Oznámení - informace

Identifikátor oznámení/verze : 497d0f3e-9b42-44ca-be5f-2f0ffab2351f - 01
Druh formuláře : Zadávání
Typ oznámení : Oznámení o zahájení zadávacího nebo koncesního řízení – standardní režim
Datum odeslání oznámení : 27/12/2024 13:39 +01:00
Jazyky, v nichž je toto oznámení oficiálně k dispozici : čeština

11.2 Informace o zveřejnění

Číslo zveřejnění oznámení : 00797157-2024
Číslo vydání v řadě S Úř. věst. : 252/2024
Datum zveřejnění : 30/12/2024