Vrijwillige transparantie vooraf: Hoge resolutie massaspectrometrie (HRMS) systeem met MALDI Imaging voor identificatie en ruimtelijke lokalisatie van (bio)moleculen

Shared Research Facilities (SRF) van Wageningen University & Research (WUR) maakt geavanceerde onderzoeksfaciliteiten beschikbaar voor onderzoekers van binnen en buiten de WUR. De apparatuur wordt geplaatst bij groepen die de apparatuur veel gebruiken, daarbij expertise opbouwen, en vervolgens het gebruik van de apparatuur voor of door anderen faciliteren. Het Laboratorium …

CPV: 38300000 Measuring instruments, 38340000 Instruments for measuring quantities, 38900000 Miscellaneous evaluation or testing instruments
Place of execution:
Vrijwillige transparantie vooraf: Hoge resolutie massaspectrometrie (HRMS) systeem met MALDI Imaging voor identificatie en ruimtelijke lokalisatie van (bio)moleculen
Awarding body:
Wageningen University & Research
Award number:
T112439

1. Koper

1.1 Koper

Officiële naam : Wageningen University & Research

2. Procedure

2.1 Procedure

Titel : Vrijwillige transparantie vooraf: Hoge resolutie massaspectrometrie (HRMS) systeem met MALDI Imaging voor identificatie en ruimtelijke lokalisatie van (bio)moleculen
Beschrijving : Shared Research Facilities (SRF) van Wageningen University & Research (WUR) maakt geavanceerde onderzoeksfaciliteiten beschikbaar voor onderzoekers van binnen en buiten de WUR. De apparatuur wordt geplaatst bij groepen die de apparatuur veel gebruiken, daarbij expertise opbouwen, en vervolgens het gebruik van de apparatuur voor of door anderen faciliteren. Het Laboratorium voor Organische Chemie (ORC) van de WUR heeft bij SRF een verzoek gedaan voor investering in het eerder genoemde hoge resolutie massa spectrometrie (HRMS) systeem met MALDI imaging. Binnen ORC wordt divers onderzoek verricht in verschillende onderzoeksrichtingen met een grote diversiteit aan verschillende stoffen die zijn gesynthetiseerd voor oppervlaktechemie, polymeren, antilichamen, peptiden, chirale stoffen en metaalcomplexen die met HRMS gekarakteriseerd moeten worden. Daarnaast wordt veel onderzoek gedaan naar metabolieten in planten en voedsel, waarvoor het belangrijk is om deze te kunnen karakteriseren met HRMS. Omdat we zeer complexe monsters analyseren, willen we de HRMS kunnen gebruiken met chromatografische (liquid chromatography; LC) scheiding en is daarom een ESI-bron, naast een MALDI source een vereiste. Voor een deel van onze onderzoekslijn richten we ons op kleine moleculen, we bedoelen moleculen met een massa tot 2000 Da, waarbij het zwaartepunt in het massabereik van 100-1000 Da. Aangezien er ook gewerkt wordt met peptiden en polymeren zou een grotere massa range tot 5000 van toegevoegde waarde zijn. Daarnaast wil ORC, samen met andere leerstoelgroepen in Wageningen, het spectrum van toepassingen in haar onderzoek verbreden door een onderzoekslijn te starten op het gebied van MS-imaging, waardoor informatie kan worden verkregen over de ruimtelijke verdeling van moleculen binnen een monster en de selectiviteit van HRMS (in vergelijking met microscopietechnieken) behouden blijft. Eén van de uitdagingen in MS (beide LC- en MALDI-MS) analyse van kleine moleculen is de identificatie van individuele moleculen in complexe mengsels. Identificatie van kleine moleculen vereist (i) nauwkeurige bepaling van de massa’s (accurate mass) van deze moleculen om hun elementaire compositie en isotopenpatronen te bepalen, (ii) gebruik van een gestandaardiseerde MS/MS methode om (sub)structurele elementen te identificeren en om te matchen met spectrale bibliotheken en (iii) zeer gevoelige detectie over grote dynamische range om zelfs stoffen die in lage hoeveelheden aanwezig zijn te detecteren. Daarnaast is het vanwege de complexiteit van de monsters een vereiste dat de MS beschikt over een hoge massaresolutie (≥ 150,000 bij FWHM). Binnen onze afdeling werken studenten en onderzoekers na introductie zelfstandig met de apparatuur. Daarom is het van belang dat massakalibratie makkelijk en snel verloopt en met behulp van een lockspray of interne calibratie langdurig stabiel blijft zonder tussenkomst van de gebruiker. Omdat het om complexe apparatuur gaat die jaarlijks preventief onderhoud nodig heeft en mogelijk monteur bezoek om opgetreden complicaties te verhelpen is het wenselijk leverancier een vestiging heeft in de Benelux om hierin te kunnen voorzien. De zeer vereenvoudigde basisvereisten voor het systeem zijn hierboven benoemd in punten (i)-(iii). Om volledig te kunnen voldoen aan de behoeften van ORC, SRF en andere gebruikers van binnen en buiten de WUR is het van belang dat het HRMS systeem een uitgebreid specifiek eisenpakket vervult. Dit specifieke eisenpakket wordt in detail beschreven in Appendix B. Compatibiliteit met de infrastructuur die al aanwezig is bij ORC is essentieel. Daarom moeten het HRMS systeem in de beschikbare ruimte passen die nu aanwezig is Daarom zijn de maximale dimensies het MALDI-HRMS systeem l × b × h = 250 × 100 × 180 cm om te garanderen dat de apparatuur in deze ruimte past. De HRMS moet compatibel zijn met de DESI (DESI XS)-bron die al aanwezig is op de campus en binnen SRF om Imaging MS-experimenten uit te voeren met een andere ionenbron. Daarnaast moet de HRMS compatibel zijn met het LC-systeem dat al aanwezig is in het ORC-lab (from Agilent) via master/slave trigger. De door het gereedschap geproduceerde bestanden (.raw) moeten gemakkelijk converteerbaar zijn naar open source formaat (imzml) en zonder informatie te verliezen. Dit is essentieel om het gebruik van open source software voor het verwerken van MS-beeldvormingsgegevens (bijv. Metaspace) en ook die verkregen in LC-HRMS modus (bijv. MSdial, MZmine) mogelijk te maken.
Identificatiecode van de procedure : 7ab1cdaf-9897-46a5-bb5b-bdf51026b545
Interne identificatiecode : T112439
Type procedure : Onderhandelingsprocedure zonder voorafgaande oproep tot mededinging

2.1.1 Doel

Aard van het contract : Leveringen
Belangrijkste classificatie ( cpv ): 38300000 Instrumenten voor metingen
Aanvullende classificatie ( cpv ): 38340000 Instrumenten voor het meten van hoeveelheden
Aanvullende classificatie ( cpv ): 38900000 Diverse apparatuur voor beoordeling en testen

2.1.2 Plaats van uitvoering

Land : Nederland
Overal in het desbetreffende land
Aanvullende informatie : Zie documentatie

2.1.4 Algemene informatie

Rechtsgrondslag :
Richtlijn 2014/24/EU

5. Perceel

5.1 Technische ID van het kavel : LOT-0000

Titel : Vrijwillige transparantie vooraf: Hoge resolutie massaspectrometrie (HRMS) systeem met MALDI Imaging voor identificatie en ruimtelijke lokalisatie van (bio)moleculen
Beschrijving : Shared Research Facilities (SRF) van Wageningen University & Research (WUR) maakt geavanceerde onderzoeksfaciliteiten beschikbaar voor onderzoekers van binnen en buiten de WUR. De apparatuur wordt geplaatst bij groepen die de apparatuur veel gebruiken, daarbij expertise opbouwen, en vervolgens het gebruik van de apparatuur voor of door anderen faciliteren. Het Laboratorium voor Organische Chemie (ORC) van de WUR heeft bij SRF een verzoek gedaan voor investering in het eerder genoemde hoge resolutie massa spectrometrie (HRMS) systeem met MALDI imaging. Binnen ORC wordt divers onderzoek verricht in verschillende onderzoeksrichtingen met een grote diversiteit aan verschillende stoffen die zijn gesynthetiseerd voor oppervlaktechemie, polymeren, antilichamen, peptiden, chirale stoffen en metaalcomplexen die met HRMS gekarakteriseerd moeten worden. Daarnaast wordt veel onderzoek gedaan naar metabolieten in planten en voedsel, waarvoor het belangrijk is om deze te kunnen karakteriseren met HRMS. Omdat we zeer complexe monsters analyseren, willen we de HRMS kunnen gebruiken met chromatografische (liquid chromatography; LC) scheiding en is daarom een ESI-bron, naast een MALDI source een vereiste. Voor een deel van onze onderzoekslijn richten we ons op kleine moleculen, we bedoelen moleculen met een massa tot 2000 Da, waarbij het zwaartepunt in het massabereik van 100-1000 Da. Aangezien er ook gewerkt wordt met peptiden en polymeren zou een grotere massa range tot 5000 van toegevoegde waarde zijn. Daarnaast wil ORC, samen met andere leerstoelgroepen in Wageningen, het spectrum van toepassingen in haar onderzoek verbreden door een onderzoekslijn te starten op het gebied van MS-imaging, waardoor informatie kan worden verkregen over de ruimtelijke verdeling van moleculen binnen een monster en de selectiviteit van HRMS (in vergelijking met microscopietechnieken) behouden blijft. Eén van de uitdagingen in MS (beide LC- en MALDI-MS) analyse van kleine moleculen is de identificatie van individuele moleculen in complexe mengsels. Identificatie van kleine moleculen vereist (i) nauwkeurige bepaling van de massa’s (accurate mass) van deze moleculen om hun elementaire compositie en isotopenpatronen te bepalen, (ii) gebruik van een gestandaardiseerde MS/MS methode om (sub)structurele elementen te identificeren en om te matchen met spectrale bibliotheken en (iii) zeer gevoelige detectie over grote dynamische range om zelfs stoffen die in lage hoeveelheden aanwezig zijn te detecteren. Daarnaast is het vanwege de complexiteit van de monsters een vereiste dat de MS beschikt over een hoge massaresolutie (≥ 150,000 bij FWHM). Binnen onze afdeling werken studenten en onderzoekers na introductie zelfstandig met de apparatuur. Daarom is het van belang dat massakalibratie makkelijk en snel verloopt en met behulp van een lockspray of interne calibratie langdurig stabiel blijft zonder tussenkomst van de gebruiker. Omdat het om complexe apparatuur gaat die jaarlijks preventief onderhoud nodig heeft en mogelijk monteur bezoek om opgetreden complicaties te verhelpen is het wenselijk leverancier een vestiging heeft in de Benelux om hierin te kunnen voorzien. De zeer vereenvoudigde basisvereisten voor het systeem zijn hierboven benoemd in punten (i)-(iii). Om volledig te kunnen voldoen aan de behoeften van ORC, SRF en andere gebruikers van binnen en buiten de WUR is het van belang dat het HRMS systeem een uitgebreid specifiek eisenpakket vervult. Dit specifieke eisenpakket wordt in detail beschreven in Appendix B. Compatibiliteit met de infrastructuur die al aanwezig is bij ORC is essentieel. Daarom moeten het HRMS systeem in de beschikbare ruimte passen die nu aanwezig is Daarom zijn de maximale dimensies het MALDI-HRMS systeem l × b × h = 250 × 100 × 180 cm om te garanderen dat de apparatuur in deze ruimte past. De HRMS moet compatibel zijn met de DESI (DESI XS)-bron die al aanwezig is op de campus en binnen SRF om Imaging MS-experimenten uit te voeren met een andere ionenbron. Daarnaast moet de HRMS compatibel zijn met het LC-systeem dat al aanwezig is in het ORC-lab (from Agilent) via master/slave trigger. De door het gereedschap geproduceerde bestanden (.raw) moeten gemakkelijk converteerbaar zijn naar open source formaat (imzml) en zonder informatie te verliezen. Dit is essentieel om het gebruik van open source software voor het verwerken van MS-beeldvormingsgegevens (bijv. Metaspace) en ook die verkregen in LC-HRMS modus (bijv. MSdial, MZmine) mogelijk te maken.
Interne identificatiecode : T112439

5.1.1 Doel

Aard van het contract : Leveringen
Belangrijkste classificatie ( cpv ): 38300000 Instrumenten voor metingen
Aanvullende classificatie ( cpv ): 38340000 Instrumenten voor het meten van hoeveelheden
Aanvullende classificatie ( cpv ): 38900000 Diverse apparatuur voor beoordeling en testen

5.1.2 Plaats van uitvoering

Land : Nederland
Overal in het desbetreffende land
Aanvullende informatie : Zie documentatie

5.1.6 Algemene informatie

Aanbestedingsproject dat niet uit EU-fondsen wordt gefinancierd
De aanbesteding valt onder de Overeenkomst inzake overheidsopdrachten (GPA) : ja

5.1.16 Nadere inlichtingen, bemiddeling en evaluatie

Organisatie voor beroepsprocedures : Rechtbank Gelderland

6. Resultaten

Waarde van alle contracten toegekend in deze kennisgeving : 500 Euro

6.1 ID resultaat perceel : LOT-0000

6.1.2 Informatie over winnaars

Winnaar :
Officiële naam : Waters Chromatography B.V.
Inschrijving :
Identificatiecode van de inschrijving : T112439
Identificatiecode van het perceel of de groep percelen : LOT-0000
Waarde van het resultaat : 500 000 Euro
Onderaanneming : Neen
Waarde onderaanneming is bekend : neen
Percentage onderaanneming is bekend : neen
Informatie over het contract :
Identificatiecode van het contract : T112439
Titel : Turnkey levering hoge resolutie massaspectrometrie (HRMS) systeem met MALDI Imaging voor identificatie en ruimtelijke lokalisatie van (bio)moleculen, inclusief onderhoud
Datum waarop de winnaar is gekozen : 06/11/2024
De opdracht wordt gegund in het kader van een raamovereenkomst : neen

8. Organisaties

8.1 ORG-0001

Officiële naam : Wageningen University & Research
Registratienummer : 09215846
Postadres : Droevendaalsesteeg 4
Stad : Wageningen
Postcode : 6708PB
Onderverdeling land (NUTS) : Zuidwest-Gelderland ( NL224 )
Land : Nederland
Contactpunt : Sander Dillema
Telefoon : +31 627370553
Internetadres : https://www.wur.nl
Rollen van deze organisatie :
Koper

8.1 ORG-0002

Officiële naam : Rechtbank Gelderland
Registratienummer : 82940827
Afdeling : locatie Arnhem
Postadres : Walburgstraat 2-4
Stad : Arnhem
Postcode : 6811CD
Onderverdeling land (NUTS) : Arnhem/Nijmegen ( NL226 )
Land : Nederland
Telefoon : +31 0883612000
Rollen van deze organisatie :
Organisatie voor beroepsprocedures

8.1 ORG-0003

Officiële naam : Waters Chromatography B.V.
Omvang van de ondernemer : Groot
De organisatie is een natuurlijk persoon
Registratienummer : 20073836
Postadres : Florijnstraat 19
Stad : Etten-Leur
Postcode : 4879AH
Land : Nederland
Telefoon : +31 765087200
Internetadres : https://www.waters.com
Rollen van deze organisatie :
Inschrijver
Winnaar van deze percelen : LOT-0000
De winnaar is genoteerd op een gereglementeerde markt

11. Informatie over een aankondiging

11.1 Informatie over een aankondiging

Identificatiecode/versie van de aankondiging : e1f0fdde-7244-472d-a75b-71ef3018ab9a - 01
Type formulier : Vooraankondiging onderhandse gunning
Type aankondiging : Aankondiging in geval van vrijwillige transparantie vooraf
Verzenddatum van de aankondiging : 11/11/2024 08:21 +00:00
Aankondiging datum verzending (eSender) : 11/11/2024 08:26 +00:00
Talen waarin deze aankondiging officieel beschikbaar is : Nederlands

11.2 Informatie over de bekendmaking

Publicatienummer aankondiging : 00686956-2024
Nummer uitgave PB S : 220/2024
Datum van bekendmaking : 12/11/2024